Ten problem rozwiązałem sam, gdyby ktoś kiedyś szukał tej informacji podaję jak:
Prestashop w żaden sposób nie chciała się zmusić do współpracy, nie reagowała też na poprawne ustawienia, na czyszczenie Cache z poziomu wydajności jak i kasowanie folderów pamięci na serwerze.
Poczcie Polskiej w sposobie dostawy którą Presta na siłę dawała do koszyka jako najtańszą wysyłkę choć taka nie była i choć wskazywałem aby to było DHL zmieniłem nazwę na wysyłkę DHL i nadałem jego ustawienia kosztów wysyłki a DHLowi nadałem nazwę poczta polska i ustawienia kosztów poczty.
Mówiąc krótko zamieniłem te dwa sposoby dostaw miejscami. I teraz jak wcześniej presta na siłę wskazywała wysyłkę pocztą jako najtańszą nawet jeśli taka nie była to teraz wskazuje mi DHL jako najtańszą tak jak chciałem.
Mimo wszystko liczyłem że uda się to zrobić w sposób logiczny, programowy a nie cwaniacki i kombinatorski.