Generalnie nie ma to wpływu, jeśli logujesz się na serwerze i nie masz pierwotnie utworzonego katalogu public_html, wgrywasz pliki bezpośrednio. Nie jestem pewna, na pewno są tutaj fachowcy i mogliby się wypowiedzieć, ale przypuszczam, że się nie mylę. Korzystam z serwera bez katalogu public_html oraz z serwera z tym katalogiem, w pierwszym przypadku nie tworzyłam żadnego katalogu, chyba musiałabym potem wpisywać ścieżkę public_html w pasku przeglądarki, nie widzę sensu za bardzo.