Dzięki za szybką odpowiedź.
Zdecydowałem się na instalację sklepu na public.html, to prostsze rozwiązanie.
Natomiast nie bardzo rozumiem twoje sformułowanie że domena nie jest bezpieczna, rzeczywiście domena 
www.sklep.pl jest na sprzedaż, ale czy to ma dla mnie znaczenie jeżeli moja domena to 
www.nuni.sklep.pl ?
Czy sugerujesz, że należałoby postawić sklep na domenie np. 
www.nuni.com.pl, która należy także do mnie ?
Pozdrawiam.