najprosciej to replikacja wybranych tabel mysql, ale tego nie zrobisz sam tylko hosting, chyba ze masz dedyki.
druga opcja - napisac skrypcik synchronizacyjny, podpiac pod crona./moze byc w formie modulow/
trzecia - przerobic klase mysql, aby wg warunkow laczyla sie z dwoma bazami danych.
czwarta - backup wybranych tabel, odtworzenie aktualizacyjne na drugim,
piata - przerobienie klas, aby wybrane dane pobierac nie z bazy tylko przez webService - najdrozsze i najtrudniejsze rozwiazanie.
itp, itd.
sposobow jest masa, wszystko zalezy od uwarunkowan, dostepnych technologii, ograniczen.
idealem byloby - aby te dwa sklepy byly na tej samej bazie (inne prefixy), wtedy napisac 3 trigery (insert, update, delete) na tabele i po sprawie - wykonujesz tylko modyfikacje na bazie danych, skryptow sklepu nie ruszasz
innym rozwiazaniem jest wykonanie widokow z nazwami tabel drugiego sklepu