Nie jestem pewna czy dobrze rozumiem Twoje pytanie, ale generalnie i ja miałam problemy z thickboxem. Bardzo ważne jest ustawienie najpierw rozmiaru zdjęcia w thickboxie, co jest oczywiste, a potem koniecznie "Wygeneruj miniatury" na nowo. Jeśli ustawisz thickbox na sobie znany rozmiar, w takim Ci się wyświetli wszystko.
Drugi wariant, jeśli zrozumiałam pytanie błędnie, to szerokość obramowania thickboxa. Ja zlikwidowałam wszystko w thickboxie, co mi przeszkadzało, wyświetla mi się tylko zdjęcie, zostawiłam tylko solid i nic więcej, rozmiar mam ustawiony na 300/300px ponieważ nie potrzebuję więcej, a najchętniej pozbyłabym się thickboxa, ale nie ma znaczenia rozmiar, po zmianie i kolejnym wygenerowaniu miniatur zobaczysz zdjęcia w rozmiarze, w jakim chcesz.